醫(yī)院開放病床818張，設有52個臨床科室，42個專業(yè)，10個醫(yī)技科室，39個專家、?？萍岸鄬W科門診，在職職工千余人(含長航疾控中心)，具有中、高級職稱技術人員320余人。武漢輕工大學碩士生導師13人，湖北中醫(yī)藥大學、武漢大學醫(yī)學院兼職教授20余人。設置了武漢輕工大學-武漢腦科醫(yī)院·長江航運總醫(yī)院護理學系和康復科學系兩個臨床教學機構，獲批湖北省政府學位委員會和湖北省教育廳省級研究生工作站1個。

神經(jīng)外科是湖北省臨床重點?？?，神經(jīng)內(nèi)科、康復醫(yī)學科、感染科、老年病科、放射科、藥學科是武漢市臨床重點?？?，骨外科是武漢市臨床重點建設專科。醫(yī)院與中科院武漢病毒所合作建立了神經(jīng)系統(tǒng)疾病資源庫與聯(lián)合實驗室，是武漢醫(yī)師協(xié)會神經(jīng)外科醫(yī)師分會主委單位。

腦科是醫(yī)院的重點學科，是省、市級臨床重點?？?，擁有一支的團隊。依托于北京天壇醫(yī)院和德國柏林醫(yī)院的技術合作，率先在省內(nèi)設立小兒神經(jīng)外科、功能神經(jīng)外科、卒中單元、神經(jīng)介入科、神經(jīng)康復等?？疲氏嚷?lián)合多學科開設眩暈門診、記憶門診、睡眠門診、頭痛門診、癲癇帕金森病等特色多學科專家門診。現(xiàn)已成功開展涵蓋顱內(nèi)、椎管內(nèi)所有部位的腫瘤顯微手術，如腦干腫瘤、丘腦腫瘤、三腦室腫瘤、髓內(nèi)腫瘤等以及顱內(nèi)動脈瘤和腦血管畸形、頑固性癲癇、三叉神經(jīng)痛、面肌痙攣、小兒先天畸形、顱腦外傷、高血壓腦出血等各種手術，“卒中單元”以早期溶栓、血管介入、康復等調節(jié)技術于一體。醫(yī)院常年聘請北京天壇醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)、外科及神經(jīng)介入、神經(jīng)放射等20余名國內(nèi)、外專家為客座專家，每月定期邀請北京天壇醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)、外科專家來院主持專家門診，開展查房、手術、疑難病會診及教學查房。