2016-2019 年，共牽頭科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃重點(diǎn)專項(xiàng)項(xiàng)目 9項(xiàng)。中國科學(xué)技術(shù)信息研究所公布的 2018年度中國科技論文統(tǒng)計(jì)結(jié)果”中顯示, 共發(fā)表SCI 收錄論文546篇,SCI論文數(shù)在排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第1 位、上海市醫(yī)療機(jī)構(gòu)第2 位、交大醫(yī)學(xué)院第1 位。SCI 學(xué)科影響因子前 1/10 的期刊論文篇數(shù) 64 篇排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)中第 6 位。國際論文被引用篇數(shù)排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 17 位、上海市第 4 位、交大醫(yī)學(xué)院第 3 位。中國卓越論文篇數(shù) 281 篇，排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 31 位、上海市醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 6 位、交大醫(yī)學(xué)院第 4 位。2018 年度，醫(yī)院共申請專利 419 項(xiàng)，授權(quán)專利 204 項(xiàng)。獲評 2018 年度上海市三甲醫(yī)院科研竟?fàn)幜ε琶?2 位。

醫(yī)院重視國際對外交流。醫(yī)院與瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院、美國約翰霍普金斯醫(yī)院、法國巴黎公立醫(yī)院集團(tuán)、哈佛大學(xué)牙醫(yī)學(xué)院，德國杜伊斯堡埃森大學(xué) MC 口腔醫(yī)學(xué)院，荷蘭 Acta 中心、美國波士頓大學(xué)牙學(xué)院、馬里蘭大學(xué)牙學(xué)院、新加坡國立大學(xué)牙學(xué)院、日本福岡齒科大學(xué)等相關(guān)友好姐妹院校建立了長期的互訪交流關(guān)系。