2015-2019 年間，醫(yī)院獲局級(jí)以上科研項(xiàng)目立項(xiàng)993項(xiàng)，科研總經(jīng)費(fèi) 5.69 億元。近年來醫(yī)院獲自然科學(xué)基金項(xiàng)目逐年遞增，2019 年項(xiàng)目總數(shù)破百，共計(jì) 106 項(xiàng)，近五年自然科學(xué)基金項(xiàng)目總經(jīng)費(fèi)達(dá) 2.01 億元。

2016-2019 年，共牽頭科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃重點(diǎn)專項(xiàng)項(xiàng)目 9項(xiàng)。中國科學(xué)技術(shù)信息研究所公布的 2018年度中國科技論文統(tǒng)計(jì)結(jié)果”中顯示, 共發(fā)表SCI 收錄論文546篇,SCI論文數(shù)在排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第1 位、上海市醫(yī)療機(jī)構(gòu)第2 位、交大醫(yī)學(xué)院第1 位。SCI 學(xué)科影響因子前 1/10 的期刊論文篇數(shù) 64 篇排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)中第 6 位。國際論文被引用篇數(shù)排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 17 位、上海市第 4 位、交大醫(yī)學(xué)院第 3 位。中國卓越論文篇數(shù) 281 篇，排名全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 31 位、上海市醫(yī)療機(jī)構(gòu)第 6 位、交大醫(yī)學(xué)院第 4 位。2018 年度，醫(yī)院共申請(qǐng)專利 419 項(xiàng)，授權(quán)專利 204 項(xiàng)。獲評(píng) 2018 年度上海市三甲醫(yī)院科研竟?fàn)幜ε琶?2 位。