醫(yī)院科研實力強，2008年以來，獲科技進步一等獎3項、二等獎3項，軍隊科技進步一等獎2項，軍隊醫(yī)療成果一等獎7項，陜西省科學進步一等獎10項。SCI論文數(shù)1784篇，被引用篇數(shù)、引用次數(shù)和表現(xiàn)不俗論文數(shù)量均排名全國醫(yī)療機構(gòu)第二，新增臨床研究中心、自然科學基金委創(chuàng)新研究群體、科技部重點領(lǐng)域創(chuàng)新團隊、教育部創(chuàng)新團隊、全軍科技創(chuàng)新群體各1個，2010年至2014年國科金項目數(shù)連續(xù)五年破百，項目數(shù)和經(jīng)費數(shù)均排名全國醫(yī)院前茅。2012年，醫(yī)院科技創(chuàng)新、機制創(chuàng)新、文化創(chuàng)新“三個創(chuàng)新”管理經(jīng)驗轉(zhuǎn)發(fā)全國、全軍衛(wèi)生系統(tǒng)，人民日報、解放軍報、光明日報、科技日報、健康報等五家中央媒體在頭版頭條進行深度報道。