醫(yī)院作為深圳大學(xué)第一附屬醫(yī)院和第一臨床醫(yī)學(xué)院,臨床教學(xué)與醫(yī)療實踐緊密結(jié)合,建立了深圳市衛(wèi)生系統(tǒng)第一個完整的教學(xué)體系;始終堅持“醫(yī)教協(xié)同”的發(fā)展理念,積極整合院內(nèi)外優(yōu)質(zhì)教育資源,教學(xué)水平得到了提升。醫(yī)院現(xiàn)有博士研究生培養(yǎng)專業(yè)4個,博士研究生指導(dǎo)教師10名;碩士研究生培養(yǎng)專業(yè)26個,碩士研究生指導(dǎo)教師82名;2014年獲批臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點,開深圳市臨床專業(yè)學(xué)位碩士研究生教育之先河。亦與中山大學(xué)醫(yī)學(xué)部、南方醫(yī)科大學(xué)等六所國內(nèi)知名高等醫(yī)學(xué)院校建立了良好的教學(xué)合作關(guān)系,成為其臨床教學(xué)醫(yī)院或研究生培養(yǎng)基地。