廈門長庚醫(yī)院的醫(yī)療科室設(shè)置齊全，包括內(nèi)科系統(tǒng)、外科系統(tǒng)、婦科、兒科、耳鼻喉科、口腔科、皮膚科、檢驗(yàn)、病理、影像等 32 余個(gè)臨床和醫(yī)技科室。醫(yī)院重點(diǎn)發(fā)展具有國際前沿水準(zhǔn)的人工耳蝸、唇腭裂、骨科關(guān)節(jié)重建、心臟介入調(diào)節(jié)、醫(yī)美整形等特色醫(yī)療項(xiàng)目，重點(diǎn)發(fā)展整合型醫(yī)療中心如顱顏中心、醫(yī)美中心、整形中心、健檢中心等。廈門長庚是全國 20 所人工電子耳蝸定點(diǎn)手術(shù)醫(yī)院之一，具備三級(jí)助產(chǎn)機(jī)構(gòu)資質(zhì);是福建省大醫(yī)學(xué)院福建醫(yī)科大學(xué)的教學(xué)基地、于金明院士指導(dǎo)平臺(tái)之定點(diǎn)醫(yī)院;目前設(shè)有內(nèi)科、外科、婦產(chǎn)科、兒科、口腔科、耳鼻喉科、急診科、皮膚科、麻醉科共 9 個(gè)住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地。醫(yī)院配備先進(jìn)的醫(yī)療設(shè)備，擁有福建省第一臺(tái)銳速刀、VARIAN CLINACIX 型號(hào)直線加速器、16 牌大孔徑螺旋 CT、128 切 CT、彩色多普勒超聲系統(tǒng)等儀器，醫(yī)療設(shè)備達(dá)國際先進(jìn)水平，為高品質(zhì)的醫(yī)療服務(wù)提供了有力保障。醫(yī)院始終堅(jiān)持“以病患為中心”的服務(wù)宗旨，實(shí)行“醫(yī)管分治”模式，建立分科經(jīng)營制度，設(shè)立專科經(jīng)營助理，行政協(xié)助醫(yī)療，采主診醫(yī)師制，完全資訊化作業(yè);兩岸醫(yī)療精英團(tuán)隊(duì)協(xié)作，并透過全責(zé)護(hù)理制度，共同為民眾提供優(yōu)質(zhì)醫(yī)療服務(wù)。