醫(yī)院與共和國同齡、創(chuàng)建于1949年，始稱東北工人醫(yī)院，其前身是東北軍區(qū)第十一兵站醫(yī)院，承擔著黑山、塔山阻擊戰(zhàn)的醫(yī)療救護任務，為保障遼沈戰(zhàn)役傷病員的醫(yī)療救治做了大量工作。1960年6月，醫(yī)院改稱“中國醫(yī)學科學院遼寧分院南湖醫(yī)院”，逐步開展了胸外科和骨外科的研究工作。